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系統生物醫學研究所藥物平台

时间:2019-05-18 08:00:00  来源:  作者:
計算機輔助藥物設計
 
系统所药学平台具有多年的药物设计经验,可进行虚拟筛选,化合物与蛋白对接,分子动力学等研究。本平台具有大型且结构信息明确的化合物实体库,含Chemdiv库、Specs库和北京大学药学院特色库,共计超过11万独立分子。本平台采用最为全面、最新版本的計算機輔助藥物設計软件,包括Schrödinger、Sybyl、Discovery Studio、Pipeline Studio、AutoDock、OpenEye、Gromacs、LigBuilder等,并配有16核16节点的256核集群运算服务器。本平台可利用现有技术及高效的自动化流程,进行大规模、高通量的虚拟筛选,并在短时间内根据药物靶点结构找到可能的、结构全新的活性靶头化合物。可与合作方团队紧密配合,应用各种计算工具和资源,帮助合作方解决新药研发过程中的各种问题,如生物活性、选择性以及代谢稳定性等。
 
1. 基于結構的藥物設計
·        分子对接和虚拟筛选
·        同源建模
·        全新分子的产生与优化
2. 基于配體的藥物設計
·        药效基团模拟和虚拟筛选
·        分子构象分析
·        定量结构活性关系
3. 藥物代謝和類藥性質的計算
·        快速预测分子的物理化学性质
·        基于配体或者结构的hERG模拟和P450的模拟
 
藥物化學
 
系统所药学平台的藥物化學团队可以完成合作方的靶标化合物的发现,先导化合物的发现和先导化合物的优化。
 1.1.jpg
  • 爲靶標化合物的發現進行構架設計
  • 新設計構架的初步知識産權分析
  • 爲先導化合物的發現(LG)和先導化合物的優化(LO)合成化合物庫
  • 進行構效關系分析
  • 計算機輔助藥物設計和多样性分析
  • 專利申請准備
  • 推薦合適的DMPK和體外毒理學研究對關鍵化合物的推進提供幫助
 
樣品凍幹服務
 
系统所药学平台拥有Labconco® FreeZone® (Plus) 2.5 L 冷冻干燥系统;FreeZone® Plus™ 2.5 L 立式冷冻干燥系统,可提供样品的冻干服务。样品主要为水样,尽量不含有机酸和有机溶剂。
儀器參數如下:
1.2.jpg
 
● 最低冷阱温度可达-84℃
● 最大集冰量:2.5 L,24 小时除水量:-50℃机型为2 L,-84℃机型为2.2 L
● 1/3 hp 无氟制冷压缩机,冷阱温度-50℃ , 或双1/3 hp 无氟制冷压缩机,冷阱温度-84℃
● 主机材质:环氧树脂涂层钢柜体
● LCD 数字显示真空度(10-3 mbar)、冷阱温度及报警信息
● 多点LED 形成波形图,根据其亮的点数可一眼知晓相应真空度和温度
● 可一键全自动控制致冷和抽真空;也可进行手动实现二者分别控制
● 湿度探测器可在内腔有水份时阻止真空启动
● 真空终止阀可在系统关闭的情况下自动将空气泄入系统,如果系统在5 分钟内恢复供电,真空和冷阱可自动重启
● 8 针数据接口,可通过记录仪或电脑采集和监控冷阱温度及真空度
● 侧装电源开关和后置式电插座(用于连接真空泵)
● 后置的RS-232 接口,用于数据导出
● 一个带有直径3英寸的连接孔,用于连接干燥室的冷阱盖
 
聯系方式:
林志強老師
電話:82805805
郵箱:lzq107@126.com

 

 
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